Es una situación muy rara porque Google suele dar de alta automáticamente las farmacias en su directorio.
Comprueba primero que realmente tu farmacia no aparece en el buscador. Entra en Google.es y busca farmacia en población, por ejemplo farmacia en Torrelodones. AHora en los resultados pulsa la opción Maps
Desplázate en el mapa hasta tu ubicación y comprueba que ciertamente tu farmacia no aparece.
Ahora que estamos seguros que la farmacia no existe vamos a darla de alta.
Te recomiendo seguir el proceso en Google My Business y no en Maps.
Abre Google My Business e inicia sesión (arriba a la derecha) con el usuario de Google de la farmacia. Y ya puedes comenzar a crear el perfil de tu farmacia, es realmente sencillo.